Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3AP98173 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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FAM3AP98173 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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FAM3AP98173 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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FAM3AP98173 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM3AP98173 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM3AP98173 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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FAM3AP98173 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3AP98173 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3AP98173 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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