Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms