Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
rp9P97762 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
rp9P97762 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
rp9P97762 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
rp9P97762 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
rp9P97762 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
rp9P97762 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
rp9P97762 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
rp9P97762 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
rp9P97762 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
rp9P97762 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
rp9P97762 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
rp9P97762 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
rp9P97762 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
rp9P97762 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
rp9P97762 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
rp9P97762 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
rp9P97762 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
rp9P97762 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
rp9P97762 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
rp9P97762 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
rp9P97762 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
rp9P97762 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
rp9P97762 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
rp9P97762 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
rp9P97762 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
rp9P97762 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
rp9P97762 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
rp9P97762 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
rp9P97762 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
rp9P97762 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
rp9P97762 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
rp9P97762 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
rp9P97762 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
rp9P97762 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
rp9P97762 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
rp9P97762 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
rp9P97762 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
rp9P97762 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
rp9P97762 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
rp9P97762 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
rp9P97762 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
rp9P97762 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
rp9P97762 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
rp9P97762 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
rp9P97762 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
rp9P97762 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
rp9P97762 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
rp9P97762 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
rp9P97762 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
rp9P97762 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
rp9P97762 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
rp9P97762 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
rp9P97762 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
rp9P97762 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
rp9P97762 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
rp9P97762 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
rp9P97762 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
rp9P97762 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
rp9P97762 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
rp9P97762 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
rp9P97762 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
rp9P97762 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
rp9P97762 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
rp9P97762 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
rp9P97762 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
rp9P97762 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
rp9P97762 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
rp9P97762 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms