Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx2P97474 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pitx2P97474 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms