Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4cP97470 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4cP97470 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppp4cP97470 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4cP97470 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms