Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Psme1P97371 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psme1P97371 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Psme1P97371 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psme1P97371 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psme1P97371 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Psme1P97371 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Psme1P97371 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Psme1P97371 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Psme1P97371 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Psme1P97371 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Psme1P97371 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psme1P97371 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Psme1P97371 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Psme1P97371 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms