Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pkp1P97350 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms