Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFI35P80217 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFI35P80217 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFI35P80217 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFI35P80217 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFI35P80217 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFI35P80217 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFI35P80217 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFI35P80217 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFI35P80217 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFI35P80217 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFI35P80217 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFI35P80217 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFI35P80217 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFI35P80217 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFI35P80217 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFI35P80217 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFI35P80217 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFI35P80217 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFI35P80217 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFI35P80217 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFI35P80217 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFI35P80217 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFI35P80217 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFI35P80217 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFI35P80217 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFI35P80217 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFI35P80217 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFI35P80217 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFI35P80217 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFI35P80217 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFI35P80217 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFI35P80217 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFI35P80217 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFI35P80217 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFI35P80217 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFI35P80217 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFI35P80217 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFI35P80217 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFI35P80217 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFI35P80217 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFI35P80217 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFI35P80217 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFI35P80217 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFI35P80217 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFI35P80217 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFI35P80217 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFI35P80217 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFI35P80217 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFI35P80217 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFI35P80217 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFI35P80217 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFI35P80217 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFI35P80217 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFI35P80217 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFI35P80217 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.2 ms