Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX5P78411 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX5P78411 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX5P78411 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX5P78411 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX5P78411 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX5P78411 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX5P78411 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX5P78411 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX5P78411 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX5P78411 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX5P78411 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX5P78411 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX5P78411 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX5P78411 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX5P78411 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX5P78411 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX5P78411 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX5P78411 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX5P78411 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX5P78411 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX5P78411 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX5P78411 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX5P78411 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX5P78411 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX5P78411 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX5P78411 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX5P78411 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX5P78411 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX5P78411 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX5P78411 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX5P78411 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX5P78411 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX5P78411 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX5P78411 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX5P78411 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX5P78411 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX5P78411 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX5P78411 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX5P78411 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX5P78411 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX5P78411 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX5P78411 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX5P78411 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX5P78411 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX5P78411 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX5P78411 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX5P78411 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX5P78411 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX5P78411 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX5P78411 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX5P78411 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX5P78411 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX5P78411 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX5P78411 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX5P78411 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.9 ms