Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F2P78329 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F2P78329 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms