Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frat1P70339 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frat1P70339 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frat1P70339 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frat1P70339 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frat1P70339 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms