Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tbx1P70323 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx1P70323 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms