Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxna1P70206 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna1P70206 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxna1P70206 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms