Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPM4P67936 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPM4P67936 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPM4P67936 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPM4P67936 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPM4P67936 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM4P67936 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM4P67936 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM4P67936 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM4P67936 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM4P67936 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM4P67936 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM4P67936 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM4P67936 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM4P67936 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM4P67936 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM4P67936 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM4P67936 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM4P67936 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM4P67936 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM4P67936 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM4P67936 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM4P67936 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM4P67936 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM4P67936 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM4P67936 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM4P67936 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM4P67936 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM4P67936 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM4P67936 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM4P67936 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM4P67936 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM4P67936 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM4P67936 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM4P67936 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM4P67936 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM4P67936 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM4P67936 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM4P67936 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM4P67936 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM4P67936 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM4P67936 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM4P67936 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM4P67936 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM4P67936 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM4P67936 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM4P67936 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM4P67936 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM4P67936 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM4P67936 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM4P67936 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM4P67936 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM4P67936 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM4P67936 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms