Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl31P62900 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl31P62900 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms