Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB1P62873 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GNB1P62873 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB1P62873 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB1P62873 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB1P62873 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB1P62873 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB1P62873 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GNB1P62873 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GNB1P62873 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GNB1P62873 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GNB1P62873 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GNB1P62873 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GNB1P62873 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GNB1P62873 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GNB1P62873 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GNB1P62873 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GNB1P62873 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GNB1P62873 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GNB1P62873 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms