Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME3P61289 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME3P61289 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME3P61289 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME3P61289 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME3P61289 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME3P61289 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME3P61289 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME3P61289 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME3P61289 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME3P61289 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME3P61289 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME3P61289 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME3P61289 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME3P61289 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME3P61289 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME3P61289 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME3P61289 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME3P61289 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME3P61289 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME3P61289 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME3P61289 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME3P61289 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME3P61289 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSME3P61289 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSME3P61289 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSME3P61289 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSME3P61289 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSME3P61289 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSME3P61289 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSME3P61289 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSME3P61289 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME3P61289 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME3P61289 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME3P61289 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME3P61289 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME3P61289 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME3P61289 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME3P61289 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms