Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm2aP59997 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2aP59997 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2aP59997 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms