Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samsn1P57725 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms