Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SIK1P57059 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIK1P57059 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIK1P57059 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIK1P57059 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIK1P57059 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIK1P57059 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIK1P57059 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIK1P57059 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIK1P57059 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIK1P57059 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIK1P57059 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIK1P57059 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIK1P57059 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIK1P57059 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIK1P57059 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIK1P57059 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIK1P57059 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIK1P57059 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIK1P57059 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIK1P57059 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIK1P57059 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIK1P57059 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIK1P57059 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIK1P57059 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIK1P57059 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIK1P57059 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIK1P57059 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIK1P57059 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIK1P57059 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIK1P57059 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIK1P57059 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIK1P57059 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIK1P57059 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIK1P57059 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIK1P57059 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIK1P57059 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIK1P57059 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIK1P57059 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIK1P57059 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIK1P57059 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIK1P57059 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIK1P57059 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SIK1P57059 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIK1P57059 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIK1P57059 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SIK1P57059 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIK1P57059 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIK1P57059 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIK1P57059 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIK1P57059 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIK1P57059 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIK1P57059 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIK1P57059 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIK1P57059 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIK1P57059 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIK1P57059 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIK1P57059 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIK1P57059 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIK1P57059 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIK1P57059 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIK1P57059 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIK1P57059 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIK1P57059 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIK1P57059 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIK1P57059 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIK1P57059 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIK1P57059 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIK1P57059 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIK1P57059 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIK1P57059 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIK1P57059 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SIK1P57059 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIK1P57059 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIK1P57059 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SIK1P57059 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SIK1P57059 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SIK1P57059 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIK1P57059 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIK1P57059 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIK1P57059 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIK1P57059 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIK1P57059 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIK1P57059 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIK1P57059 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIK1P57059 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIK1P57059 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIK1P57059 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIK1P57059 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SIK1P57059 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIK1P57059 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIK1P57059 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms