Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp5P56399 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp5P56399 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp5P56399 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp5P56399 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp5P56399 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp5P56399 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms