Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKNOX1P55347 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKNOX1P55347 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX1P55347 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms