Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMP3P54852 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMP3P54852 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMP3P54852 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMP3P54852 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMP3P54852 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMP3P54852 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMP3P54852 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMP3P54852 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMP3P54852 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMP3P54852 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMP3P54852 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMP3P54852 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMP3P54852 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMP3P54852 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMP3P54852 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMP3P54852 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMP3P54852 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMP3P54852 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMP3P54852 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMP3P54852 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMP3P54852 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMP3P54852 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EMP3P54852 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMP3P54852 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMP3P54852 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMP3P54852 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMP3P54852 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMP3P54852 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMP3P54852 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMP3P54852 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMP3P54852 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMP3P54852 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMP3P54852 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMP3P54852 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMP3P54852 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMP3P54852 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMP3P54852 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMP3P54852 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMP3P54852 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMP3P54852 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMP3P54852 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMP3P54852 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms