Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NrlP54846 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NrlP54846 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NrlP54846 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NrlP54846 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NrlP54846 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NrlP54846 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NrlP54846 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NrlP54846 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NrlP54846 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NrlP54846 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NrlP54846 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NrlP54846 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NrlP54846 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NrlP54846 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NrlP54846 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NrlP54846 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NrlP54846 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NrlP54846 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NrlP54846 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NrlP54846 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NrlP54846 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NrlP54846 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NrlP54846 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NrlP54846 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NrlP54846 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NrlP54846 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NrlP54846 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NrlP54846 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NrlP54846 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NrlP54846 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NrlP54846 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NrlP54846 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NrlP54846 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NrlP54846 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NrlP54846 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NrlP54846 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NrlP54846 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NrlP54846 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NrlP54846 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NrlP54846 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NrlP54846 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NrlP54846 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NrlP54846 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NrlP54846 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms