Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 BABAM1-210ENST00000598567 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.28□□□□□ -0.284e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 BABAM1-215ENST00000601232 690 ntTSL 512.95□□□□□ -0.344e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 TMEM101-206ENST00000590905 573 ntTSL 511.33□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 PARK7-210ENST00000497113 670 ntTSL 311.25□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 38
SUB1P53999 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 BABAM1-204ENST00000594247 1004 ntTSL 510.15□□□□□ -0.784e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 TMEM101-202ENST00000585950 682 ntTSL 310.09□□□□□ -0.794e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.984e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 TMEM101-203ENST00000586174 593 ntTSL 48.7□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.124e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 TMEM101-208ENST00000592127 576 ntTSL 47.54□□□□□ -1.24e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 GPN1-202ENST00000407583 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 GPN1-210ENST00000515877 1646 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.314e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 MFSD1-205ENST00000465624 1029 ntTSL 34.88□□□□□ -1.634e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 MFSD1-204ENST00000465235 2042 ntTSL 24.67□□□□□ -1.664e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.674e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.724e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.774e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 CFH-203ENST00000466229 6985 ntTSL 1 (best)3.43□□□□□ -1.864e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.094e-8■■■■■ 38
SUB1P53999 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.797e-20■■■■■ 37.9
SUB1P53999 PLOD3-206ENST00000454310 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.75□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.768e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 MDH1-213ENST00000485781 893 ntTSL 28.57□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 MDH1-209ENST00000462944 634 ntTSL 37□□□□□ -1.298e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 MDH1-206ENST00000436321 680 ntTSL 35.85□□□□□ -1.478e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 MDH1-208ENST00000454035 575 ntTSL 34.45□□□□□ -1.78e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 MDH1-210ENST00000472098 936 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.738e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 MDH1-212ENST00000485155 571 ntTSL 1 (best)3.56□□□□□ -1.848e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 MDH1-207ENST00000442225 785 ntTSL 53.05□□□□□ -1.928e-8■■■■■ 37.9
SUB1P53999 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 37.8
SUB1P53999 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.278e-8■■■■■ 37.8
SUB1P53999 YIPF3-214ENST00000510102 1639 ntTSL 513.39□□□□□ -0.272e-14■■■■■ 37.8
SUB1P53999 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.357e-8■■■■■ 37.8
SUB1P53999 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.448e-8■■■■■ 37.8
SUB1P53999 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-14■■■■■ 37.8
SUB1P53999 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 37.8
SUB1P53999 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.612e-14■■■■■ 37.8
SUB1P53999 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.748e-8■■■■■ 37.8
SUB1P53999 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.88e-8■■■■■ 37.8
SUB1P53999 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.416e-13■■■■■ 37.8
SUB1P53999 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.416e-13■■■■■ 37.8
SUB1P53999 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.526e-13■■■■■ 37.8
SUB1P53999 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.636e-13■■■■■ 37.8
SUB1P53999 AP2B1-219ENST00000620039 3428 ntTSL 1 (best)4.55□□□□□ -1.686e-13■■■■■ 37.8
SUB1P53999 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.852e-17■■■■■ 37.8
SUB1P53999 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-15■■■■■ 37.8
SUB1P53999 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-15■■■■■ 37.8
SUB1P53999 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-15■■■■■ 37.8
SUB1P53999 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-15■■■■■ 37.8
SUB1P53999 EIF6-206ENST00000447927 932 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.482e-15■■■■■ 37.8
SUB1P53999 EIF6-205ENST00000440766 798 ntTSL 212.08□□□□□ -0.482e-15■■■■■ 37.8
SUB1P53999 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.562e-15■■■■■ 37.8
SUB1P53999 GLRX5-202ENST00000553672 912 ntTSL 26.46□□□□□ -1.382e-8■■■■■ 37.8
SUB1P53999 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 519.81■□□□□ 0.765e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.535e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 NSMCE4A-211ENST00000489266 2399 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.295e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 215.38■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MRPL28-209ENST00000481453 2229 ntTSL 214.66□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MRPL28-208ENST00000469744 1467 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MRPL28-210ENST00000483764 1512 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.225e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.35e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MRPL28-207ENST00000461550 1478 ntTSL 512.98□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.355e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 SNHG16-205ENST00000587743 2665 nt12.72□□□□□ -0.375e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 MAGEA6-203ENST00000457643 921 ntTSL 312.56□□□□□ -0.45e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 TMCO3-203ENST00000460039 864 ntTSL 312.49□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 TMCO3-210ENST00000620021 3542 ntTSL 410.4□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 510.3□□□□□ -0.765e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 TMCO3-209ENST00000619336 575 ntTSL 410.29□□□□□ -0.765e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 RMI2-202ENST00000572173 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.865e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.925e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.935e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.975e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ATP2A2-202ENST00000313432 5575 ntTSL 1 (best)7.93□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 METTL9-206ENST00000564733 5603 nt7.81□□□□□ -1.165e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 RNF8-208ENST00000498460 835 ntTSL 37.31□□□□□ -1.245e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.315e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC5.64□□□□□ -1.515e-8■■■■■ 37.7
Retrieved 100 of 11,644 protein–RNA pairs in 253.6 ms