Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp1P52624 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Upp1P52624 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp1P52624 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Upp1P52624 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Upp1P52624 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Upp1P52624 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Upp1P52624 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Upp1P52624 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp1P52624 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Upp1P52624 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upp1P52624 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upp1P52624 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Upp1P52624 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upp1P52624 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Upp1P52624 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp1P52624 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp1P52624 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Upp1P52624 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp1P52624 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp1P52624 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Upp1P52624 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp1P52624 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp1P52624 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upp1P52624 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upp1P52624 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Upp1P52624 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp1P52624 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp1P52624 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp1P52624 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp1P52624 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166 ms