Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ercc3P49135 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms