Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC10P48553 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms