Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nedd4P46935 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms