Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIA3P42263 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms