Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 RER2YBR002C 861 nt4.74□□□□□ -1.65
SOK1P40317 snR17bsnR17b 332 nt4.74□□□□□ -1.65
SOK1P40317 THP1YOL072W 1368 nt4.74□□□□□ -1.65
SOK1P40317 PRP43YGL120C 2304 nt4.74□□□□□ -1.65
SOK1P40317 MBP1YDL056W 2502 nt4.74□□□□□ -1.65
SOK1P40317 COQ6YGR255C 1440 nt4.73□□□□□ -1.65
SOK1P40317 MEC3YLR288C 1425 nt4.73□□□□□ -1.65
SOK1P40317 ROT2YBR229C 2865 nt4.73□□□□□ -1.65
SOK1P40317 NPY1YGL067W 1155 nt4.73□□□□□ -1.65
SOK1P40317 ETR1YBR026C 1143 nt4.73□□□□□ -1.65
SOK1P40317 SSO1YPL232W 873 nt4.73□□□□□ -1.65
SOK1P40317 ZUO1YGR285C 1302 nt4.72□□□□□ -1.65
SOK1P40317 NUP1YOR098C 3231 nt4.72□□□□□ -1.65
SOK1P40317 RCK1YGL158W 1539 nt4.72□□□□□ -1.65
SOK1P40317 NOP7YGR103W 1818 nt4.72□□□□□ -1.65
SOK1P40317 TRS23YDR246W 660 nt4.72□□□□□ -1.65
SOK1P40317 IPK1YDR315C 846 nt4.72□□□□□ -1.65
SOK1P40317 RPL3YOR063W 1164 nt4.72□□□□□ -1.65
SOK1P40317 KRS1YDR037W 1776 nt4.72□□□□□ -1.65
SOK1P40317 SAP155YFR040W 3009 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 THI21YPL258C 1656 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 SLC1YDL052C 912 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 SCM3YDL139C 672 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 FHN1YGR131W 525 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 CAB4YGR277C 918 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 SCW10YMR305C 1170 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 MRP21YBL090W 534 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 FUI1YBL042C 1920 nt4.71□□□□□ -1.66
SOK1P40317 MSH1YHR120W 2880 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 YMR245WYMR245W 621 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 BBP1YPL255W 1158 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 DNF2YDR093W 4839 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 MCM4YPR019W 2802 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 FHL1YPR104C 2811 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 AXL2YIL140W 2472 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 DOA1YKL213C 2148 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 NOT3YIL038C 2511 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 ECM7YLR443W 1347 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 PMA1YGL008C 2757 nt4.7□□□□□ -1.66
SOK1P40317 CPS1YJL172W 1731 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 IWR1YDL115C 1062 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 CDC21YOR074C 915 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 NPT1YOR209C 1290 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 ADE3YGR204W 2841 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 YNL247WYNL247W 2304 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 YTA12YMR089C 2478 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 TFC7YOR110W 1308 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 UBX7YBR273C 1311 nt4.69□□□□□ -1.66
SOK1P40317 KRE6YPR159W 2163 nt4.68□□□□□ -1.66
SOK1P40317 APE1YKL103C 1545 nt4.68□□□□□ -1.66
SOK1P40317 ATP14YLR295C 375 nt4.68□□□□□ -1.66
SOK1P40317 CDC28YBR160W 897 nt4.68□□□□□ -1.66
SOK1P40317 PRO2YOR323C 1371 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 BLM10YFL007W 6432 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 SRG1SRG1 551 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 YDR417CYDR417C 372 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 SEH1YGL100W 1050 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 RPB4YJL140W 666 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 YJU2YKL095W 837 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 YLR283WYLR283W 945 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 GIP1YBR045C 1920 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 FZO1YBR179C 2568 nt4.67□□□□□ -1.66
SOK1P40317 FRE1YLR214W 2061 nt4.66□□□□□ -1.66
SOK1P40317 VID30YGL227W 2877 nt4.66□□□□□ -1.66
SOK1P40317 PEX29YDR479C 1665 nt4.66□□□□□ -1.66
SOK1P40317 MNT2YGL257C 1677 nt4.66□□□□□ -1.66
SOK1P40317 IES1YFL013C 2079 nt4.66□□□□□ -1.66
SOK1P40317 ALG2YGL065C 1512 nt4.66□□□□□ -1.66
SOK1P40317 MTC1YJL123C 1437 nt4.65□□□□□ -1.66
SOK1P40317 TRX2YGR209C 315 nt4.65□□□□□ -1.67
SOK1P40317 TEF4YKL081W 1239 nt4.65□□□□□ -1.67
SOK1P40317 MIM2YLR099W-A 264 nt4.65□□□□□ -1.67
SOK1P40317 TLG2YOL018C 1194 nt4.65□□□□□ -1.67
SOK1P40317 ZPS1YOL154W 750 nt4.65□□□□□ -1.67
SOK1P40317 EMP46YLR080W 1335 nt4.65□□□□□ -1.67
SOK1P40317 GPR1YDL035C 2886 nt4.65□□□□□ -1.67
SOK1P40317 PCA1YBR295W 3651 nt4.64□□□□□ -1.67
SOK1P40317 GCN20YFR009W 2259 nt4.64□□□□□ -1.67
SOK1P40317 THI5YFL058W 1023 nt4.64□□□□□ -1.67
SOK1P40317 YGR016WYGR016W 573 nt4.64□□□□□ -1.67
SOK1P40317 THI12YNL332W 1023 nt4.64□□□□□ -1.67
SOK1P40317 MET8YBR213W 825 nt4.64□□□□□ -1.67
SOK1P40317 MSE1YOL033W 1611 nt4.64□□□□□ -1.67
SOK1P40317 PGM2YMR105C 1710 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 APJ1YNL077W 1587 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 YDR134CYDR134C 411 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 SUR2YDR297W 1050 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 YEL067CYEL067C 588 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 SKI6YGR195W 741 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 FMP33YJL161W 543 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 FUN19YAL034C 1242 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 TRS33YOR115C 807 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 YPL041CYPL041C 624 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 TGS1YPL157W 948 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 RAD16YBR114W 2373 nt4.63□□□□□ -1.67
SOK1P40317 GAL4YPL248C 2646 nt4.62□□□□□ -1.67
SOK1P40317 LHP1YDL051W 828 nt4.62□□□□□ -1.67
SOK1P40317 YGR122WYGR122W 1209 nt4.62□□□□□ -1.67
SOK1P40317 MRL1YPR079W 1146 nt4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 328.9 ms