Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Chd1P40201 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Chd1P40201 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Chd1P40201 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Chd1P40201 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Chd1P40201 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Chd1P40201 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Chd1P40201 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Chd1P40201 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Chd1P40201 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Chd1P40201 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Chd1P40201 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Chd1P40201 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Chd1P40201 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Chd1P40201 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Chd1P40201 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.3 ms