Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk2P38575 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk2P38575 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk2P38575 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk2P38575 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upk2P38575 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upk2P38575 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms