Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGP37231 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGP37231 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGP37231 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGP37231 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGP37231 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGP37231 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGP37231 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGP37231 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGP37231 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGP37231 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGP37231 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGP37231 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGP37231 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGP37231 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGP37231 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGP37231 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGP37231 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGP37231 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGP37231 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGP37231 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGP37231 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGP37231 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGP37231 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGP37231 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGP37231 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGP37231 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGP37231 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms