Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acvr1P37172 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms