Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA3P35244 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA3P35244 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA3P35244 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA3P35244 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA3P35244 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA3P35244 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA3P35244 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA3P35244 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA3P35244 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA3P35244 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA3P35244 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA3P35244 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA3P35244 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA3P35244 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA3P35244 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA3P35244 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA3P35244 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA3P35244 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA3P35244 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA3P35244 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA3P35244 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA3P35244 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPA3P35244 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RPA3P35244 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA3P35244 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA3P35244 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA3P35244 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA3P35244 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA3P35244 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA3P35244 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA3P35244 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA3P35244 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA3P35244 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA3P35244 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA3P35244 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA3P35244 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA3P35244 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA3P35244 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA3P35244 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA3P35244 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA3P35244 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA3P35244 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA3P35244 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPA3P35244 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms