Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pola1P33609 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pola1P33609 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pola1P33609 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pola1P33609 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pola1P33609 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pola1P33609 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms