Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SsbP32067 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SsbP32067 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SsbP32067 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SsbP32067 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SsbP32067 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SsbP32067 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SsbP32067 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SsbP32067 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SsbP32067 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SsbP32067 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SsbP32067 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SsbP32067 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SsbP32067 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SsbP32067 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SsbP32067 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SsbP32067 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SsbP32067 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SsbP32067 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SsbP32067 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SsbP32067 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SsbP32067 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SsbP32067 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SsbP32067 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SsbP32067 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SsbP32067 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SsbP32067 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SsbP32067 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SsbP32067 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SsbP32067 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SsbP32067 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SsbP32067 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SsbP32067 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SsbP32067 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SsbP32067 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms