Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA6P31267 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms