Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxc10P31257 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc10P31257 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc10P31257 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms