Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tacr1P30548 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms