Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp1P29452 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casp1P29452 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp1P29452 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp1P29452 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp1P29452 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms