Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RxrgP28705 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RxrgP28705 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RxrgP28705 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxrgP28705 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxrgP28705 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RxrgP28705 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RxrgP28705 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RxrgP28705 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RxrgP28705 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RxrgP28705 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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