Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept4P28661 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept4P28661 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept4P28661 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept4P28661 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept4P28661 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept4P28661 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept4P28661 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sept4P28661 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms