Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmi1P25916 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms