Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PparaP23204 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PparaP23204 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PparaP23204 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PparaP23204 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PparaP23204 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PparaP23204 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PparaP23204 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PparaP23204 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PparaP23204 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PparaP23204 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PparaP23204 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PparaP23204 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PparaP23204 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PparaP23204 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PparaP23204 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PparaP23204 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PparaP23204 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PparaP23204 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PparaP23204 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PparaP23204 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PparaP23204 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PparaP23204 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PparaP23204 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PparaP23204 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PparaP23204 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PparaP23204 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PparaP23204 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PparaP23204 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PparaP23204 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PparaP23204 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PparaP23204 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PparaP23204 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PparaP23204 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PparaP23204 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PparaP23204 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PparaP23204 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PparaP23204 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PparaP23204 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PparaP23204 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PparaP23204 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PparaP23204 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PparaP23204 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PparaP23204 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PparaP23204 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PparaP23204 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PparaP23204 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PparaP23204 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PparaP23204 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PparaP23204 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PparaP23204 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PparaP23204 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PparaP23204 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PparaP23204 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PparaP23204 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PparaP23204 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PparaP23204 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PparaP23204 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PparaP23204 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PparaP23204 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PparaP23204 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PparaP23204 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PparaP23204 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PparaP23204 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PparaP23204 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PparaP23204 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PparaP23204 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms