Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS4Y1P22090 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS4Y1P22090 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS4Y1P22090 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms