Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MgpP19788 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MgpP19788 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MgpP19788 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MgpP19788 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MgpP19788 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MgpP19788 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MgpP19788 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MgpP19788 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MgpP19788 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MgpP19788 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MgpP19788 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MgpP19788 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MgpP19788 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MgpP19788 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MgpP19788 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MgpP19788 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MgpP19788 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MgpP19788 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MgpP19788 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MgpP19788 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MgpP19788 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MgpP19788 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MgpP19788 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MgpP19788 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MgpP19788 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MgpP19788 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MgpP19788 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MgpP19788 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MgpP19788 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MgpP19788 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MgpP19788 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MgpP19788 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MgpP19788 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MgpP19788 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MgpP19788 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MgpP19788 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MgpP19788 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MgpP19788 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms