Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox4i1P19783 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox4i1P19783 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms