Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefhP19246 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NefhP19246 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefhP19246 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefhP19246 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefhP19246 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefhP19246 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefhP19246 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefhP19246 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefhP19246 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefhP19246 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefhP19246 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefhP19246 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefhP19246 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NefhP19246 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefhP19246 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefhP19246 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefhP19246 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefhP19246 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefhP19246 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefhP19246 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefhP19246 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefhP19246 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefhP19246 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefhP19246 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefhP19246 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefhP19246 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefhP19246 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefhP19246 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefhP19246 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefhP19246 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefhP19246 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefhP19246 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefhP19246 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefhP19246 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefhP19246 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefhP19246 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefhP19246 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefhP19246 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NefhP19246 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefhP19246 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefhP19246 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefhP19246 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefhP19246 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefhP19246 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefhP19246 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefhP19246 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefhP19246 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefhP19246 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NefhP19246 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NefhP19246 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefhP19246 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms